İTÜ İşletme Mühendisliği Bölümü'nün kökleri, 1910 yılında bugünkü İTÜ'nün öncülü olan Yüksek Mühendis Mektebi'nde iktisat derslerinin verilmeye başlanmasına kadar uzanır. İlerleyen yıllarda, İTÜ'nün çeşitli bölümlerinde yetişen mühendisleri genel iktisat ve hukuk bilgisiyle donatma amacıyla 1971 yılında Temel Bilimler Fakültesi çatısı altında bir kürsü kurulmuş; bu birikimin üzerine, işletmelerin teknik kadroları ile sosyal bilimler eğitimi almış yönetici kadroları arasında bağ kurabilecek nitelikte insan gücü ihtiyacını karşılamak üzere 1977 yılında İTÜ'de İşletme Mühendisliği eğitimi başlamıştır.
1979 yılında yüksek lisans, 1995 yılında doktora eğitimine başlanmış; 1982 yılında İşletme Mühendisliği Bölümü, Endüstri Mühendisliği Bölümü ile birlikte İşletme Fakültesi çatısı altında birleşmiş, yüksek lisans programı da Fen Bilimleri Enstitüsü bünyesine geçmiştir. O tarihten bu yana bölüm, mühendislik ile yönetim ve ekonomi bilimlerini bütünleştiren özgün eğitim anlayışını lisans, yüksek lisans, doktora ve yöneticilere yönelik MBA programları aracılığıyla sürdürmektedir.
İlerleyen yıllarda program, çağdaş yükseköğretim ölçütleriyle sürekli güncellenmiştir. 1996'da üniversite genelinde benimsenen iki dilli eğitim modeliyle İngilizce ağırlığı artmış; program, Anglo-Amerikan eğitim modeline uygun olarak yeniden yapılandırılmış ve bu yapı 2003–2004 akademik yılında yürürlüğe girmiştir. Eğitim kalitesini uluslararası düzeyde güvence altına alma çalışmaları, lisans programının 2009 yılında ABET Mühendislik Akreditasyon Komisyonu (EAC) tarafından akredite edilmesiyle sonuçlanmıştır. 2010 yılında, Türkçe programın yanı sıra İngilizce İşletme Mühendisliği lisans programı açılmış; 2018 yılında ise lisans eğitiminde %100 İngilizce modeline geçilmiştir.
Bugün İTÜ İşletme Mühendisliği Bölümü, köklü akademik geleneğini çağdaş yönetim, veri bilimi ve karar sistemleri yaklaşımlarıyla birleştirerek; kurulduğu günden bu yana yetiştirdiği binlerce mezunuyla ulusal ve uluslararası düzeyde iz bırakmaya ve özgün bilgi üretmeye devam etmektedir.
